हर्बल दवाओं का "वैज्ञानिक रूप से" उपयोग करने के दो तरीके हैं। एक उन्हें प्राकृतिक फार्मेसी के रूप में उपयोग करना है। हर पौधे में असंख्य रसायन होते हैं जो शरीर में असंख्य तरीकों से काम करते हैं। क्योंकि ये पौधे बहुत, बहुत लंबे समय से आसपास हैं, हम जानते हैं कि कैसे उन सभी छोटे-छोटे प्रभावों से एक ही लाभ जुड़ जाता है जो शायद हमें किसी अन्य दवा से नहीं मिल सकता है। एक अन्य तरीका यह है कि उनका उपयोग उन एकल रसायनों के स्रोत के रूप में किया जाए जिनके ज्ञात प्रभाव हैं, और उस रसायन की ज्ञात मात्रा प्रदान करने के लिए जड़ी-बूटियों को मानकीकृत करना है। जिस तरह से हम सेंट जॉन पौधा का मानकीकरण करते हैं (आपको अवसाद को प्रभावित करने के लिए जड़ी बूटी के लिए एक दिन में 900 मिलीग्राम हाइपरिसिन प्राप्त करने के लिए पर्याप्त सेंट जॉन पौधा चाहिए) और ग्रीन टी कैटेचिन (आपको इन ग्रीन टी रसायनों की एक निश्चित खुराक की आवश्यकता है) के साथ यही विचार है। वजन घटाने पर असर पड़ता है), उदाहरण के लिए।
आम तौर पर, हर्बल दवाएं केवल ऐसी दवाएं होती हैं जो प्राकृतिक और कोमल होती हैं, जब वे कैसे काम करती हैं, इस ज्ञान के साथ उपयोग की जाती हैं। आप हर्बल दवाओं का उपयोग हर्बल से होने वाली दवाओं के रूप में कर सकते हैं। लोक चिकित्सा में जड़ी-बूटियों के उपयोग को जादुई शब्दों में व्यक्त किया जाता है, पारंपरिक चीनी चिकित्सा में जड़ी-बूटियों के उपयोग को प्रतीकात्मक शब्दों में व्यक्त किया जाता है (जैसे कि जापानी, कोरियाई, आयुर्वेद, यूनानी, और इसी तरह), और यह जरूरी नहीं कि खराब व्यवस्थाएं हों। वे सिर्फ "वैज्ञानिक" नहीं हैं।